二零二零年年初，本港爆發2019冠狀病毒病。在疫症蔓延，人心虛怯之際，懲教人員仍處變不驚，充分發揮對社會的使命感，義不容辭出心獻力，幫助社會度過難關。

二零二零年一月初，有報導指內地出現一種具傳染性病毒，並有蔓延跡象。根據二零零三年處理「沙士」所得的經驗，署方估計政府部門對口罩的需求可能急增，於是早著先機，在一月初已調動內部資源提升口罩產量，並開始加班生產口罩。與此同時，署方亦開始購買額外口罩生產機器及原材料以應付急增的需求。

其後，疫情日益嚴峻，市面上口罩短缺。為此，署方採取主動，積極研究各個增加口罩產量的方案。最後決定打破常規，安排羅湖懲教所口罩工場破天荒24小時運作，並徵集現職和退休懲教人員以及文職人員擔任義工製造口罩。這羣現職及退休人員滿腔熱誠，無私付出，希望各盡一分力，協助香港戰勝疫情。一眾義工合共工作逾40 000小時，超過2 500人次參與，口罩生產量為每月400多萬個。

二零二零年四月，有見及市面上的兒童口罩供應緊絀，本署發揮香港人靈活變通的精神，迅即把一條半自動生產線改裝成生產兒童口罩。署方隨後亦於赤柱監獄及東頭懲教所增設過濾口罩生產線，進一步提高口罩生產量。自二零二零年一月初起，署方已將口罩生產量由以往每月平均約110萬個，增加至最高峰時的每月約540萬個，以解各政府部門和學校口罩不足的困境。

這次疫情揭示本港缺乏本地生產的個人防護裝備，有見及此，本署即時向政府提出建議，建立「個人防護裝備生產基地」，於羅湖懲教所及大欖懲教所設立新的生產線生產保護衣、保護帽和保護面罩等個人防護裝備。此舉不僅為政府的防疫工作提供強大後盾，並可培養在囚人士的社會責任感，讓他們有機會為鞏固本地公營醫療體系出一分力。

即使疫情來勢洶洶，但愛羣義工團關愛社羣之心卻絲毫不減。他們一如以往，竭誠服務不同社羣。二零二零年，愛羣義工團主要參與的活動包括於羅湖懲教所進行的口罩生產義工計劃，超過2 500名團員參與。此外，雖然有些義工服務受疫情影響不得不延後或取消，但在可行情況下，義工團仍參與各項防疫義工活動，包括包裝及派發口罩予基層市民和長者、探訪長者及向他們派發抗疫福袋，並分享抗疫資訊。

二零一九年，香港持續發生大規模的暴亂事件。在社會紛擾之際，部分懲教人員本着對社會的使命感，挺身而出，自願成為首批特別任務警察，跨越平常執勤的圍牆，在院所以外協助警方守護香港。首批特別任務警察於二零一九年十一月正式執勤，他們主要來自懲教署區域應變隊，職責包括守衛政府處所、協助防暴行動及處理突發事件等。隨後，其他紀律部隊人員亦陸續加入成為特別任務警察，協助維持治安，讓香港社會早日回復安寧。